生物医疗数据研究部负责生物信息处理与挖掘、中医数据整合与挖掘、医疗保险数据整合与挖掘、医院数据资源开发和利用等。在生物数据方面开发了生物数据集成系统、基因表达谱数据挖掘平台和转录因子结合位点及其组合模块挖掘平台；在医疗数据方面开发了医保基金风险防控平台、中医多元信息采集平台等。